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生態系とは、地球上の生物とそれを取り巻く環境システムを指す。
【生態・環境】分野では、現地でのフィールドワークを通して陸や海や川なども含めた生態系の保全を研究。【地域環境工学・計画学】【環境農学(含ランドスケープ科学)】では、農村や山間部、そして国立公園や緑地計画がなしえる生態系保全を考察。【生物多様性・分類】では島に生息する固有種などを含めた、多様な生態系の保護を考える。
【森林科学】では昆虫の行動を追い、土壌の成分や栄養分を分析することで、森林における生態系の実態解明に貢献。【水圏生産科学】では海藻やプランクトンの循環を捕捉し、海中の生態系を研究。【生物資源保全学】では野生動物の生態や移動を調査し、人間活動からの保護を行う。